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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
26/12/2018 |
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Data da última atualização: |
24/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARVALHO, V. P.; SANT'ANNA, I. C.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; CRUZ, C. D.; ARBEX, W. A.; OLIVEIRA, F. C.; SILVA, F. F. |
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Afiliação: |
V. P. CARVALHO; I. C. SANT'ANNA; M. NASCIMENTO; A. C. C. NASCIMENTO; C. D. CRUZ; WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL; F. C. OLIVEIRA; F. F. SILVA. |
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Título: |
Support vector machines applied to the genetic classification problem of hybrid populations with high degrees of similarity. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 17, n. 4, gmr18122, 2018. |
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Páginas: |
10 p. |
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DOI: |
10.4238/gmr18122 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ABSTRACT Selection of appropriate genitors in breeding programs increases gains due to the variability found in the divergent groups; this allows quantification of the existing variability, saving time and resources. There are many methods for quantification and evaluation of diversity in population studies, among which we highlight methods that are based on multivariate statistical analyses, such as linear discriminant analysis (LDA) and cluster analysis. Here we propose and evaluate the use of Support Vector machine (SVM) and Artificial Neural Network (ANN) in an attempt to solve the problem of genetic classification of hybrid populations with high degrees of similarity. The results obtained, in terms of the apparent error rate (APER), were compared with those obtained using ANN analysis and LDA. In general, the lowest APER values were associated with scenarios with low degrees of genetic similarity between populations. Specifically, the best results obtained through SVM (ranging from 14.44 to 67.41%) were observed when the exponential radial base kernel function was used. The APERs obtained by the ANN were even lower than those of the linear discriminant function. |
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Palavras-Chave: |
Computational Intelligence; Multivariate approach. |
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Thesaurus Nal: |
Breeding. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 02004naa a2200265 a 4500
001 2102505
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260 $c2018
300 $a10 p.
520 $aABSTRACT Selection of appropriate genitors in breeding programs increases gains due to the variability found in the divergent groups; this allows quantification of the existing variability, saving time and resources. There are many methods for quantification and evaluation of diversity in population studies, among which we highlight methods that are based on multivariate statistical analyses, such as linear discriminant analysis (LDA) and cluster analysis. Here we propose and evaluate the use of Support Vector machine (SVM) and Artificial Neural Network (ANN) in an attempt to solve the problem of genetic classification of hybrid populations with high degrees of similarity. The results obtained, in terms of the apparent error rate (APER), were compared with those obtained using ANN analysis and LDA. In general, the lowest APER values were associated with scenarios with low degrees of genetic similarity between populations. Specifically, the best results obtained through SVM (ranging from 14.44 to 67.41%) were observed when the exponential radial base kernel function was used. The APERs obtained by the ANN were even lower than those of the linear discriminant function.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 10 | |
| 1. |  | COSTA, W. de M.; LAVANDER, H. D.; OLIVEIRA, L.; SOUZA, A. B. de; GÁLVEZ, A. O.; ARANA, L. A. V. Remoção de compostos nitrogenados e fosfatados de efluentes por meio de reator anaeróbico com fluxo ascendente. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 8, p. 1168-1170, ago. 2013. Notas Científicas.
Título em inglês: Removal of nitrogen and phosphate compounds from wastewater by an upward?flow anaerobic reactor.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 2. | | Silva, C. R. da; Andrade Júnior, A. S. de; Alves Júnior, J.; Souza, A. B. de; Melo, F. de B.; Coelho Filho, M. A. Calibração de uma sonda de capacitância em um Argissolo. Scientia Agricola, Piracicaba, v. 64, n. 6, p.636-640, nov/dez, 2007| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 3. | | SILVA, C. R. da; ANDRADE JUNIOR, A. S. de; ALVES JÚNIOR, J.; SOUZA, A. B. de; MELO, F. de B.; COELHO FILHO, M. A. Calibration of a capacitance probe in a paleudult. Scientia Agrícola, Piracicaba, v. 64, n. 6, p. 636-640, Nov./Dec. 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio-Norte. |
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| 5. | | SALAZAR, D. U.; DEMATTÊ, J. A. M.; VICENTE, L. E.; GUIMARÃES, C. C.; SOUZA, A. B. de; INFORSATO, L.; CARVALHO, H. W. L. de. Spectral range (FRX-VIS-NIR-SWIR-MIR) interaction on the organic matter prediction. In: WORLD CONGRESS OF SOIL SCIENCE, 21., 2018, Rio de Janeiro. Soil science: beyond food and fuel: abstracts. Viçosa, MG: SBCS, 2018. Trabalho 392.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 6. | | RODRIGUES, M. C.; LIMA, W. C.; QUESSADA, A. M.; SILVA, F. A. N.; SILVA, L. M. C.; SOUZA, A. B. de; MOURA, C. R. C. de; LIMA, D. A. S. D. Celiotomy by plastrotomy in a yellow-footed tortoise (Geochelone denticulata). Pesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF, v. 35, n. 2, p. 173-176, fev. 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 7. | | CARDOSO, M. J.; CARVALHO, H. W. L. de; ROCHA, L. M. P.; PACHECO, C. A. P.; GUIMARÃES, P. E. de O.; MELO, K. E. de O.; FEITOSA, L. F.; RODRIGUES, C. S.; SOUZA, A. B. de. Recomendação de híbridos de milho para a Região Meio-Norte do Brasil: safra 2006/2007. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2008. 5 p. (Embrapa Meio-Norte. Comunicado Técnico, 211).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 8. | | CARDOSO, M. J.; CARVALHO, H. W. L. de; ROCHA, L. M. P.; PACHECO, C. A. P.; GUIMARÃES, P. E. de; MELO, K. E. de O.; FEITOSA, L. F.; RODRIGUES, C. S.; SOUZA, A. B. de. Recomendação de híbridos de milho para a Região Meio-Norte do Brasil: safra 2006/2007. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2008. 5 p. (Embrapa Meio-Norte. Comunicado Técnico, 211).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 9. | | CARDOSO, M. J.; CARVALHO, H. W. L. de; ROCHA, L. M. P.; PACHECO, C. A. P.; MELO, K. E. de O.; FEITOSA, L. F.; RODRIGUES, C. S.; SOUZA, A. B. de. Recomendação de cultivares de milho na Região Meio-Norte do Brasil: safra 2006/2007. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2008. 6 p. (Embrapa Meio-Norte. Comunicado Técnico, 213).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 10. | | SOUZA, V. L. N. de; BRITO, M. A. A.; CHAVES, F. C. M.; LIMA, A. R. de S.; SOUZA, S. R. dos S.; BARBOSA, J. R. da S.; COSTA, A. M. da; SOUZA, D. M. P. de; SOUZA, A. B. de. Segurança da informação na Embrapa Amazônia Ocidental: boas práticas: conceitos e aplicações. Manaus: Embrapa Amazônia Ocidental, 2009. 36 p. (Embrapa Amazônia Ocidental. Documentos, 70).| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| Registros recuperados : 10 | |
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